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EDGE, le nouvel algorithme qui prévoit la toxicité des gènes

Les chercheurs de l'UTA ont développé un algorithme qui identifie les gènes dont la mise en activité est mortelle pour les cellules.

EDGEDes chercheurs de l'Université de Tel-Aviv, en collaboration avec des scientifiques de l'Institut Weizman, ont développé un algorithme informatique permettant de prévoir quels gènes métaboliques sont mortels pour les cellules  lorsqu'ils sont surexprimés. Les résultats, publiés dans la revue scientifique américaine Proceedings of the National Academy of Sciences, pourront aider les industries de la biotechnologie à produire de nouveaux produits chimiques de manière plus sûre et plus rentable.

Fonctionnant comme de petites usines, les cellules du corps métabolisent les matières premières en les convertissant en composants chimiques. La biotechnologie utilise cette propriété fondamentale du métabolisme cellulaire en utilisant des microorganismes pour produire des produits pharmaceutiques et des biocarburants. Pour stimuler la production à un niveau industriel et créer de nouveaux types de produits chimiques, ils manipulent le métabolisme naturel des microorganismes, souvent en "sur-exprimant" certains gènes des cellules. Mais cette ingénierie métabolique est entravée par le fait que de nombreux gènes, lorsqu'ils sont surexprimés, deviennent toxiques pour les cellules.

C'est pourquoi les doctorants Alon Wagner, Uri Gophna, et le Prof. Eytan Ruppin de l'Ecole d'Informatique et du Département de Microbiologie molécullaire et de Biotechnologie de l'Université de Tel-Aviv, en collaboration avec des chercheurs de l'Institut Weizman ont développé un nouvel algorithme qui permet de prévoir quels sont les gènes qui  réagissent de manière mortelle lorsqu'ils sont surexprimés.

Lire la suite sur: http://siliconwadi.fr/13218/edge-lalgorithme-israelien-qui-detecte-les-genes-toxiques.

Cet article a été publié sur http://siliconwadi.fr/ le 17/02/2014, sous le titre: "Edge, l'algorithme israélien qui détecte les gènes toxiques"

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